Ich habe eine D200. Ich habe mir Deine beiden Bilder angeschaut, die Du eingestellt hast. Also das der D200 enthält eindeutig mehr Bildinformationen (Dobermann am Tor).
Spass beiseite: Wenn ich mir die Bilder anschaue, finde ich das der S3 eindeutig knapper belichtet hat. Hier noch die EXIFs: D200=1/160 f6.3 S3=1/180 f6.7.
Die S3 hat in der Hausmauer eindeutig die bessere Zeichnung als die D200. Teilweise sicher auf den SuperCCD zurückzuführen.
Wenn Du aber Regeln Nr. 1, 2 und 3 beim RAW-fotografieren einhälst (immer etwas zu knapp belichten!!), wirst Du der S3 schon ziemlich nahe kommen mit der Nikon. Auch die von Dir kritisierten flauen Farben sollten dann eine Verbesserung erfahren.
Hmm, Dein anderes Problem (jenes, das hier keiner kapieren will

Bei den Bildern mit den Blumen ist klar der Blaustich der D200 gegenüber der S3 zu sehen. Aber aufgrund eines Bildes kann ich da nicht allzuviel sagen zu dem Thema. Oder doch: Schau Dir mal ne Sigma DSLR mit Foveon-Bildsensor an.

Gruss aus der Schweiz
Marco